只有同时满足内地外商投资准入要求、香港公司主体存续合规、标的股权无权利瑕疵三个条件的交易，才具备提交申请的基础资格。根据《外商投资准入特别管理措施（负面清单）》2024版相关规定，标的公司所属行业不在负面清单禁止投资领域，若属于限制领域需事先取得行业主管部门批复，方可推进后续流程。香港公司需为有效存续的商业实体，无未结清的税务案件、无质押冻结或处于注销流程中，需提供香港公司注册处的有效存续证明，以及香港税务部门的无欠税证明。标的股权需无质押、查封、冻结等权利限制，其他股东已出具放弃优先购买权的书面声明，不存在代持等隐性权属争议。若标的属于内地禁止外资进入的行业，或香港公司已经处于清盘状态，或标的股权存在未决权属诉讼的，均不符合申请条件，提交申请也会被直接驳回。
提交申请后出现合规性冲突、定价不合理、关联交易未披露三类问题的，审核机关将直接作出驳回决定，申请人需调整后重新提交。合规性冲突指交易实质是规避外商投资准入限制，比如通过多层代持进入负面清单禁止领域，或者交易达到《国务院关于经营者集中申报标准的规定》的申报门槛，未按要求完成经营者集中申报的，均会被直接驳回。定价不合理指股权转让定价不符合独立交易原则，根据内地税务机关及香港税务部门的相关规定，若定价明显低于标的公司净资产公允价值、或低于同期同类行业股权转让平均水平且无正当理由的，税务部门将启动纳税调整，审核流程直接中止，情节严重的直接驳回申请。关联交易未披露指交易双方属于关联方的，未完整披露关联关系、交易背景、定价依据的，将被认定为存在避税或利益输送嫌疑，直接驳回申请。申请人收到驳回通知后，需在15个工作日内按驳回意见补正或调整交易方案，逾期未补正的视为自动放弃申请，需重新走全流程提交。
申请材料分为核心要件、辅助要件两类，核心要件缺失的直接判定为无效提交，辅助要件缺失的可在规定时限内补正。核心要件包括：
非关联交易、无行业准入限制的普通股权转让全流程周期约为3-6个月，关联交易或需行业准入审批的股权转让周期约为6-12个月，费用根据交易复杂度存在差异。普通场景下，流程分为三个阶段：
交易全程需重点防控税务调整、权属纠纷、合规处罚三类风险，提前做好自查可大幅降低申请驳回概率。税务风险方面，内地税务部门对跨境股权转让的反避税审查力度较大，若定价明显偏低且无正当理由的，将要求转让方补缴税款及滞纳金，香港税务部门也会对交易利得征税，若被认定为关联交易未按独立交易原则定价的，也会作出纳税调整，建议交易前出具净资产评估报告作为定价依据。权属风险方面，若标的股权存在代持、质押等未披露的权利瑕疵，交易完成后可能出现第三方主张权利的情况，建议交易前对标的公司做全面的尽职调查，核实股权权属情况。合规处罚风险方面，若未按要求提交外商投资信息报告、或规避准入限制的，内地商务部门可处10万元以上50万元以下的罚款，情节严重的可认定交易无效，建议交易前对照负面清单确认行业准入资格，按要求提交所有申报材料。跨境股权转让完成后需按规定完成双方属地的税务申报及登记手续，避免后续出现合规风险。
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