所有取得来源于中国境内应税所得的非居民企业，均需按规定履行nra账户税款申报缴纳义务，未取得境内应税所得的主体无需就该账户存量资金缴纳相关税费。
根据国家外汇管理局2009年发布的《境外机构境内外汇账户管理规定》，境外机构境内外汇账户的开立主体为在境外（含港澳台地区）合法注册成立的机构，账户内资金所有权归属于境外注册机构，不属于境内机构或个人资产。应税所得的判定标准遵循属地原则，即所得来源于中国境内的，无论支付方是境内机构还是境外机构，均需按规定申报缴纳对应税费，应税所得范围包括但不限于境内机构支付的服务费、特许权使用费、股息红利、不动产转让所得、货物贸易项下境内收款等，不同所得类型对应的计税税率不同，目前股息红利类所得基准税率为10%，服务类所得基准税率为6%，实际适用税率以官方最新公布为准。
如果开立账户的境外机构注册地与中国签署有避免双重征税协定，且该机构符合协定中“受益所有人”条件的，可申请享受协定约定的优惠税率，部分地区股息红利类所得优惠税率可低至5%，具体以双方签署的正式税收协定文本为准。受益所有人的判定标准为对所得或所得据以产生的权利或财产具有所有权和支配权的主体，空壳公司、导管公司不属于受益所有人范畴，无法享受协定优惠待遇。
申报材料不完整、受益所有人身份认定不达标、应税所得归属划分不清三类情况，会直接导致税款申报被驳回。
材料类驳回是最常见的驳回原因，具体情形包括未提供应税所得对应的交易合同、未提供注册地有效存续证明、未提供受益所有人相关证明材料、申报税率与实际适用条件不符等，这类驳回通常会收到官方出具的补正通知，需在通知规定的时限内补充对应材料重新提交，补正时限通常为5-15个工作日，具体以评税机关告知为准。若在补正时限内提交符合要求的补充材料，原申报流程可继续推进，不会产生逾期责任。
受益所有人认定驳回主要出现在申请税收协定优惠税率的场景中，实践中如果申请主体存在空壳运营、无实质经营人员与经营场所、所得为代收代付性质、最终受益人为非协定国居民等情况，会被判定不符合受益所有人身份，无法享受约定的优惠税率，需按基准税率补缴对应税款。若对认定结果有异议，可提交实质经营的相关证明材料申请复核。
所得归属划分不清的驳回情形，通常出现在账户内同时存在境内应税所得和境外免税所得的场景中，如果企业无法提供有效凭证划分两类收入的比例，评税机关有权按合理方法核定应税所得额，若企业对核定金额有异议，需提供账户收支记录、交易凭证等证明材料申请重新核定，无法提供证明材料的需按核定金额缴纳税款。
缺少主体存续证明、交易真实性证明、受益所有人身份证明三类核心材料的申报，会被直接判定为无效申报，不产生申报效力。
主体存续证明是证明申报主体合法有效存在的核心材料，需要提供账户开立主体在注册地的合法注册文件、最新的存续证明、有权签字人的护照或同等效力证件，所有非中文材料需提供经公证的中文译本，未提供译本的材料不具备核验效力，会直接导致申报无效。若主体注册信息发生变更，还需同步提供变更证明文件，否则申报信息与主体登记信息不符的也会被判定为无效。
交易真实性证明是证明应税所得真实存在的核心材料，需要提供与应税所得对应的交易合同、付款凭证、服务交付证明或权属转移证明，若所得为特许权使用费还需提供权属登记证明，若为股息红利所得还需提供利润分配决议、持股比例证明，无法提供上述材料的，交易真实性无法被认定，申报直接判定无效。若交易涉及多方主体，还需提供完整的交易链条证明，否则无法确认所得归属的也会被判定为无效申报。
受益所有人身份证明是申请税收协定优惠税率的必备材料，申请享受税收协定优惠税率的主体，需提供注册地税务主管部门出具的居民身份证明、近一年的经营活动证明、股权架构证明、所得最终归属证明，未提供上述材料的，优惠税率申请不予认可，需按基准税率重新申报，未重新申报的原申请会被判定为无效。
常规申报、补正申报、异议申诉三类场景对应的处理时限不同，超出规定时限提交申请的需承担逾期申报责任。
常规申报的时限为应税所得产生之日起7日内，由扣缴义务人代扣代缴的需在扣缴义务发生之日起7日内申报，未设置扣缴义务人的需由境外机构自行在所得产生之日起30日内申报，逾期申报的需按日加收万分之五的滞纳金，滞纳金征收标准以官方最新公布为准。若所得涉及多个纳税年度，需按所属年度分别申报，不可合并申报。
补正申报的时限为收到补正通知之日起10个工作日内，超出补正时限未提交补充材料的，原申报直接作废，需重新提交申报，若已超过法定申报时限的，需同步承担逾期责任。补正材料需一次性提交完整，多次提交补正材料的会延长审核周期，可能导致超出法定申报时限。
异议申诉的时限为收到评税通知或驳回通知之日起15日内，需提交书面异议申请及对应证明材料，评税机关将在30-60个工作日内给出复核结果，复核期间不停止原纳税义务的执行，需先按通知要求缴纳对应税款，复核通过后多缴部分可申请退税，退税到账周期通常为10-20个工作日，具体以官方处理进度为准。
未区分账户内所得性质、未按要求留存备查材料、滥用税收协定待遇三类是最常见的合规风险，可能导致补缴税款、加收滞纳金、影响账户后续使用的后果。
未区分所得性质的风险，部分主体将境内应税所得伪装为境外往来款，未按要求申报缴纳税款，一旦被核查发现，除补缴税款和滞纳金外，情节严重的还可能被限制账户收支功能，影响后续正常经营活动。账户内所有收支都需留存对应证明材料，以备后续核验，不可将不同性质的收支混同申报。
未留存备查材料的风险，所有与账户收支相关的交易凭证、证明材料需留存至少10年备查，未按要求留存材料的，评税机关有权直接核定应税所得额，要求企业补缴对应税款。若涉及多个交易的材料缺失，核定的应税所得额通常会高于实际应缴金额，企业需承担额外的税费成本。
滥用税收协定待遇的风险，部分主体通过在协定国注册空壳公司申请优惠税率，一旦被发现不符合受益所有人条件，除补缴税款差额外，还会被列入重点监管名单，后续三年内的优惠税率申请都会被严格审核，无法快速通过核验。符合条件的主体可对照上述要求自行核验申报条件，确保相关税款缴纳合规。
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